Protein–RNA interactions for Protein: E2JF22

Piezo1, Piezo-type mechanosensitive ion channel component 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Piezo1E2JF22 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Piezo1E2JF22 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Piezo1E2JF22 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Piezo1E2JF22 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Piezo1E2JF22 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms