Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Klhl3E0CZ16 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Klhl3E0CZ16 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Klhl3E0CZ16 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms