Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5L4

5430403G16Rik, RIKEN cDNA 5430403G16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430403G16RikD3Z5L4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
5430403G16RikD3Z5L4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
5430403G16RikD3Z5L4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
5430403G16RikD3Z5L4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms