Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tpm3-rs7D3Z2H9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms