Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim30cD3YVI9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim30cD3YVI9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim30cD3YVI9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim30cD3YVI9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms