Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdzd8B9EJ80 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdzd8B9EJ80 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdzd8B9EJ80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms