Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.95■■■■■ 4.63
Abcc8B2RUS7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.92■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC43.9■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
Abcc8B2RUS7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC43.86■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC43.85■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC43.84■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC43.83■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC43.83■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Abcc8B2RUS7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC43.8■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Abcc8B2RUS7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC43.75■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC43.74■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC43.72■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
Abcc8B2RUS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Abcc8B2RUS7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms