Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usf3B2RUQ2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Usf3B2RUQ2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Usf3B2RUQ2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms