Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Prrt4B2RU40 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Prrt4B2RU40 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Prrt4B2RU40 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms