Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Zscan5bB2RTN3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Zscan5bB2RTN3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zscan5bB2RTN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms