Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slc22a28B2RT89 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Slc22a28B2RT89 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Slc22a28B2RT89 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms