Protein–RNA interactions for Protein: B1AVK5

Col4a6, Collagen, type IV, alpha 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a6B1AVK5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Col4a6B1AVK5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col4a6B1AVK5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Col4a6B1AVK5 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Col4a6B1AVK5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms