Protein–RNA interactions for Protein: A2AX52

Col6a4, Collagen alpha-4(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a4A2AX52 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Col6a4A2AX52 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Col6a4A2AX52 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Col6a4A2AX52 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.3 ms