Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VirmaA2AIV2 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VirmaA2AIV2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
VirmaA2AIV2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VirmaA2AIV2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms