Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc163A2AGD7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc163A2AGD7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ccdc163A2AGD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms