Protein–RNA interactions for Protein: A2AF53

Tmem185a, Transmembrane protein 185A, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem185aA2AF53 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem185aA2AF53 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tmem185aA2AF53 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem185aA2AF53 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms