Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprfA2A8L5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PtprfA2A8L5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtprfA2A8L5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtprfA2A8L5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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