Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Calcoco2A2A6M5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Calcoco2A2A6M5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Calcoco2A2A6M5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms