Protein–RNA interactions for Protein: A2A6A1

Gpatch8, G patch domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpatch8A2A6A1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Gpatch8A2A6A1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Gpatch8A2A6A1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Gpatch8A2A6A1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.8■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC33.78■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Gpatch8A2A6A1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Gpatch8A2A6A1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms