Protein–RNA interactions for Protein: A0AUP1

Ccdc112, Coiled-coil domain-containing protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc112A0AUP1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc112A0AUP1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc112A0AUP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc112A0AUP1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc112A0AUP1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms