Protein–RNA interactions for Protein: Q63994

Cd33, Myeloid cell surface antigen CD33, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd33Q63994 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd33Q63994 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd33Q63994 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd33Q63994 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cd33Q63994 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cd33Q63994 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cd33Q63994 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Cd33Q63994 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cd33Q63994 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cd33Q63994 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cd33Q63994 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cd33Q63994 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cd33Q63994 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cd33Q63994 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd33Q63994 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cd33Q63994 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cd33Q63994 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd33Q63994 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cd33Q63994 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd33Q63994 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cd33Q63994 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd33Q63994 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd33Q63994 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cd33Q63994 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cd33Q63994 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd33Q63994 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cd33Q63994 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cd33Q63994 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cd33Q63994 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cd33Q63994 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cd33Q63994 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd33Q63994 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd33Q63994 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cd33Q63994 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cd33Q63994 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd33Q63994 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cd33Q63994 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cd33Q63994 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cd33Q63994 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cd33Q63994 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cd33Q63994 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cd33Q63994 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cd33Q63994 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cd33Q63994 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cd33Q63994 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cd33Q63994 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Cd33Q63994 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cd33Q63994 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cd33Q63994 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms