Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Gtf3c3Q3TMP1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Gtf3c3Q3TMP1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Gtf3c3Q3TMP1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Gtf3c3Q3TMP1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Gtf3c3Q3TMP1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Gtf3c3Q3TMP1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Gtf3c3Q3TMP1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Gtf3c3Q3TMP1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Gtf3c3Q3TMP1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gtf3c3Q3TMP1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Gtf3c3Q3TMP1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Gtf3c3Q3TMP1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gtf3c3Q3TMP1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Gtf3c3Q3TMP1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gtf3c3Q3TMP1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Gtf3c3Q3TMP1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Gtf3c3Q3TMP1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Gtf3c3Q3TMP1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Gtf3c3Q3TMP1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Gtf3c3Q3TMP1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Gtf3c3Q3TMP1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Gtf3c3Q3TMP1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Gtf3c3Q3TMP1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gtf3c3Q3TMP1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf3c3Q3TMP1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Gtf3c3Q3TMP1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Gtf3c3Q3TMP1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Gtf3c3Q3TMP1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Gtf3c3Q3TMP1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Gtf3c3Q3TMP1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Gtf3c3Q3TMP1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Gtf3c3Q3TMP1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Gtf3c3Q3TMP1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Gtf3c3Q3TMP1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gtf3c3Q3TMP1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gtf3c3Q3TMP1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Gtf3c3Q3TMP1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Gtf3c3Q3TMP1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gtf3c3Q3TMP1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Gtf3c3Q3TMP1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Gtf3c3Q3TMP1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Gtf3c3Q3TMP1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gtf3c3Q3TMP1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Gtf3c3Q3TMP1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Gtf3c3Q3TMP1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Gtf3c3Q3TMP1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Gtf3c3Q3TMP1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Gtf3c3Q3TMP1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Gtf3c3Q3TMP1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Gtf3c3Q3TMP1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Gtf3c3Q3TMP1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Gtf3c3Q3TMP1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Gtf3c3Q3TMP1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
Gtf3c3Q3TMP1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms