Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Vgll3P85442 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,7■■■□□ 2,03
Vgll3P85442 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27,68■■■□□ 2,02
Vgll3P85442 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,65■■■□□ 2,02
Vgll3P85442 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,62■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Vgll3P85442 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,56■■■□□ 2
Vgll3P85442 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27,55■■■□□ 2
Vgll3P85442 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Vgll3P85442 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Vgll3P85442 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■■□□ 2
Vgll3P85442 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27,51■■□□□ 1,99
Vgll3P85442 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Vgll3P85442 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Vgll3P85442 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27,49■■□□□ 1,99
Vgll3P85442 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Vgll3P85442 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27,36■■□□□ 1,97
Vgll3P85442 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,34■■□□□ 1,97
Vgll3P85442 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Vgll3P85442 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Vgll3P85442 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Vgll3P85442 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,31■■□□□ 1,96
Vgll3P85442 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,3■■□□□ 1,96
Vgll3P85442 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Vgll3P85442 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Vgll3P85442 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Vgll3P85442 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Vgll3P85442 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Vgll3P85442 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Vgll3P85442 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Vgll3P85442 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26,93■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Vgll3P85442 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC26,84■■□□□ 1,89
Vgll3P85442 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Vgll3P85442 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,8■■□□□ 1,88
Vgll3P85442 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Vgll3P85442 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Vgll3P85442 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Vgll3P85442 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,73■■□□□ 1,87
Vgll3P85442 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Vgll3P85442 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
Vgll3P85442 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Vgll3P85442 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vgll3P85442 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Vgll3P85442 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Vgll3P85442 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,61■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,59■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Vgll3P85442 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,55■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,53■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26,52■■□□□ 1,84
Vgll3P85442 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Vgll3P85442 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7,2 ms