Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LJ72

Muc16, Mucin 16, mousemouse

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Length 8,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc16A0A140LJ72 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.33
Muc16A0A140LJ72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Muc16A0A140LJ72 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
Muc16A0A140LJ72 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.36
Muc16A0A140LJ72 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Muc16A0A140LJ72 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
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