Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ly96-201ENSMUST00000026881 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Speer3W4VSP1 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1700066B17Rik-203ENSMUST00000191299 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Speer3W4VSP1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms