Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Krt27Q9Z320 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Krt27Q9Z320 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms