Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

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Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Hdac6Q9Z2V5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hdac6Q9Z2V5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Hdac6Q9Z2V5 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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