Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Mbd3Q9Z2D8 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Mbd3Q9Z2D8 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms