Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms