Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nek4Q9Z1J2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms