Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Ccl8Q9Z121 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ccl8Q9Z121 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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