Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S6

Cldn10, Claudin-10, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn10Q9Z0S6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 AC154517.1-201ENSMUST00000222785 629 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Cldn10Q9Z0S6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Cldn10Q9Z0S6 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms