Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P3

Psmb2, Proteasome subunit beta type-2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb2Q9R1P3 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Exo1-201ENSMUST00000039725 7796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Psmb2Q9R1P3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms