Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Tnfrsf10bQ9QZM4 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms