Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim44Q9QXA7 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim44Q9QXA7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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