Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
PolkQ9QUG2 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PolkQ9QUG2 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms