Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Trappc2lQ9JME7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
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