Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hmgn5Q9JL35 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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