Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Il10-201ENSMUST00000016673 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm28722-201ENSMUST00000187630 1036 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 CT025526.1-201ENSMUST00000217327 267 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Olfr1153-201ENSMUST00000052300 957 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm44975-201ENSMUST00000207435 1390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm10230-201ENSMUST00000119362 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms