Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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