Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp29Q9ES63 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms