Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ube3bQ9ES34 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube3bQ9ES34 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms