Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SelenofQ9ERR7 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SelenofQ9ERR7 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms