Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Tfcp2Q9ERA0 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Tfcp2Q9ERA0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms