Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sil1Q9EPK6 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms