Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Smg9Q9DB90 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Smg9Q9DB90 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Smg9Q9DB90 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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