Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Smco2Q9DA21 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Smco2Q9DA21 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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