Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9R0

Rnf125, E3 ubiquitin-protein ligase RNF125, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf125Q9D9R0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Rnf125Q9D9R0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms