Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cldn34b2Q9D9N2 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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