Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Usp12Q9D9M2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms